Por volta de 1850 foi onde tudo começou quando chegaram ao Vale do Itajaí, os primeiros imigrantes alemães comandados por Hermann Otto Blumenau, iniciando assim a colonização da região. Mais tarde esta colônia passaria a ser chamada de Blumenau. Em 1854 Hermann Otto Blumenau sobe a bacia fluvial do rio Itajaí do rio Itajaí-Açú, até a confluência do rio Benedito, guiado pelo caboclo Ângelo Dias. Ali chegando, encontrou um pequeno povoado à margem esquerda do rio Itajaí-Açú.

1860 é considerado o ano efetivo do início da colonização de Indaial, com o povoamento da região por famílias brasileiras oriundas do nosso litoral - Armação, Camboriú, Itajaí e Porto Belo. Essas famílias passaram a ocupar área anteriormente habitada pelos índios Carijós, construindo choupanas à margem esquerda do rio Itajaí-Açú, promovendo a derrubada da mata para a formação de suas primeiras plantações. Fixou-se o nome de localidade de Carijós, que hoje permanece identificando um bairro de Indaial.

Em 1863, oengenheiro Emílio Odebrecht, da Colônia de Blumenau, subiu o rio Itajaí-Açú, até a confluência dos rios Itajaí do Sul e Itajaí do Oeste, registrando em seu diário a existência de habitações na barra do Rio Benedito, onde hoje se ergue a cidade de Indaial. A expedição foi ordenada pelo diretor da colônia, Dr. Hermann Otto Blumenau, e o engenheiro Emílio Odebrecht contou, em seu trabalho de exploração geográfica e científica, com a colaboração do também engenheiro Augusto Wunderwalt, de origem alemã.

No ano seguinte, Emílio Odebrecht, numa expedição feita à Lages e Curitibanos, obteve os elementos necessários para proceder a abertura de uma picada que ligasse Blumenau ao planalto. Essa picada, em 1874, se transformou no picadão de cargueiro que, durante muitos anos, foi a única ligação entre o Vale do Itajaí e Lages e Curitibanos.

Tudo indica que Indaial foi, à princípio, um ponto de pouso. Quem subia de Blumenau ou descia de Curitibanos, terminava, em Indaial, uma etapa da viagem.

Em 1872 o engenheiro Emílio Odebrecht concluiu os trabalhos de medição e distribuição dos lotes coloniais, e o levantamento geral do Vale do Itajaí determinado pelo pioneiro Dr. Hermann Otto Blumenau, elaborando um mapa geral da colônia de Blumenau, onde aparece pela primeira vez o povoado de Indaial, ali mencionado com Carijós. Com a implantação da colônia de imigrantes alemães, as famílias brasileiras, oriundas de Itajaí, Camboriú e Porto Belo venderam suas posses ou propriedades aos colonos estrangeiros, ocasionando o movimento de sertanejos para outras terras ainda não ocupadas. A partir de 1875, começaram a imigrar os italianos, que, chegando à Blumenau, eram enviados à outras regiões, para se dedicarem à novas culturas. Subindo o rio Itajaí-Açú, muitos se instalaram em Indaial, e com eles, surgiram as primeiras plantações de arroz e em 1878 chegaram à Blumenau e também à região que hoje compreende o Município de Indaial, os primeiros imigrantes poloneses.

1886 - Pela Lei Provincial 1.116, de 04 de outubro, foi criado o Distrito de INDAIAL, pertencente ao Município de Blumenau.

1893 - Pela lei Estadual nº 92, Indaial é elevada à categoria de vila, ou município, como entendem alguns historiadores.

1894 - Em 29 de maio, anulado o ato que criou então o município de Indaial, reintegrado seu território novamente ao município de Blumenau.

1934 - A 28 de fevereiro, através do Decreto 526, assinado pelo interventor federal Aristiliano Ramos, aconteceu a restauração do município de Indaial, como território desmembrado do município de Blumenau, e em 21 de março, foi solenemente instalado, abrangendo aos então distritos de Ascurra e Apiúna. Neste mesmo ano, pelo Decreto 529, de 28 de fevereiro, criada Comarca de Indaial, desmembrada de Blumenau, cuja instalação ocorreu em 15 de abril.

1963 - Ascurra é elevada à categoria de Município, desmembrado seu território no Município de Indaial.

1989 - Apiúna é elevada à categoria de Município, desmembrado seu território do Município de Indaial.

2002 - Em 21 de março, Indaial comemorou 68 anos de sua emancipação política e 32 anos de sua já tradicional FIMI - Festa da Instalação do Município de Indaial, evento instituído por obra e inspiração do Clesunin - Clube do Estudante Universitário de Indaial, com o apoio da Prefeitura Municipal e segmentos organizados da comunidade indaialense.